Stochastische Modelle der Populationsbiologie, WS 2009/2010

Zeit: Mo + Do 10-12,   Ort: 05-136

Ankündigungstext, Informationen in JOGUStINe

Ein R-Programm zur Simulation des (neutralen 2-Typ-)Wright-Fisher-Modells: WF_simulation_neutral.R
R-Programm zur Simulation des (2-Typ-)Wright-Fisher-Modells (mit Selektion und Mutation): WF_simulation.R
R-Programm zur Darstellung von n-Koaleszenten: coalescent_darstellung.R
R-Code rund um das ZFY-Beispiel: zum_ZFY_beispiel.R
R-Programm zur Simulation von Tajimas D unter dem Standard-Kingman-Koaleszenten freqspec_simulation.R und bei exponentiell wachsender Population freqspec_simulation_wachsende_pop.R
Die Daten aus Figure 2 von Parsch et al, Genetics 159, 647-657, (2001): parsch_fig2.dat, R-Code zur Analyse einiger Aspekte: parsch_fig2_analyse.R
Die Daten aus Griffiths und Tavaré, Stat. Science 9, 307-319, (1994): nuu-chah-nulth.seq, nuu-chah-nulth_anc.bas, Befehle zur Analyse mittels genetree: nuu-chah-nulth_befehle.sh

Ein Steilkurs über Martingale: steilkurs_martingale.pdf
Über schwache Konvergenz und Straffheit: steilkurs_straffheit.pdf
Ein Steilkurs über Markovketten in stetiger Zeit: steilkurs_zeitkontinuierliche_markovketten.pdf


Letzte Änderung: Feb. 2010, Matthias Birkner