Automated Electron diffraction tomography (ADT)
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Demo-Version
The demo version of the program is limited to three selected data sets (BaSO4, Natrolite, Na2Ti6O13)
ADT3D distribution
The program ADT3D is available through Nanomegas, Brussels
ADT3D Manual
A full Manual as well as long and short tutorials are available.
Automated Electron diffraction tomography (ADT)
Why electrons?
Comparison to x-ray single crystal and X-ray powder diffraction methods
Elektronenbeugungsdaten
zur Strukturanalyse werden als zeidimensionale Schnitte durch
den reziproken Raum aufgenommen. Die Aufnahme und Kombination
solcher Beugungsbilder bei verschiedenen Kippwinkeln um eine
ausgesuchte Achse ergibt einen dreidimensionalen Datensatz.
Nano Elektronenbeugung (NED) erlaubt den Elektronenstrahldurchmesser
auf ca. 10-50 nm zu beschränken. Durch Kombination mit
Abbildungen im Rastermodus entsteht eine sanfte Methode die
besonders für strahlempfindliche Materialien geeignet ist.
Für sehr kleine Kristalle niedriger Symmetrie ist die manuelle
Datensammlung sogar oft unmöglich. Deshalb entwickeln wir
zusammen mit der Firma FEI ein Modul zur automatischen Datensammlung
[1]. |
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Nachdem Zellparameter bestimmt und mittels
Röntgenpulverdaten verfeinert wurden ist eine Eingrenzung der Raumgruppe
und die Indizierung der Zonen möglich. Die Größe der
erreichbaren 3D Datensätze ist zwar mit Röntgenpulverbeugungsdaten
vergleichbar, jedoch sind die Intensitäten von dynamischer Beugung
beeinflusst und weisen Lücken im reziproken Raum auf. Dynamische
Effekte sind für organische Materialien sehr gering und können
bei der ersten Analyse der Moleküllage vernachlässigt werden.
Dieses Strukturmodell kann dann über Röntgenpulverdaten mittels
Rietveld methoden verfeinert werden [2]. Die Kombination komplementärer
Daten aus Elektroneneinkristall - und Röntgenpulverdaten stellte
sich als eine der besten Möglichkeiten heraus, die Kristallstruktur
nanokristalliner Pigmente, nicht-linear optisch aktiver organischer
Moleküle, ferroelektrischer monomere und Polymers und sogar von
Polyelektrolyten zu lösen [3-5]. In diesem Projekt werden die oben
beschriebenen Methoden zum Beispiel zur Strukturanalyse von Benzylamiddimeren
mit unterschiedlichen Substituenten, die als Benzoxazin Modellsysteme
dienen sollen, (Kooperation: SFB Projekt A7 and A8) verwendet [6]. Desweiteren
werden Untersuchungen an Oligo(p-benzamid)-b-poly(ethylene glycol) Blockcopolymeren
und den Oligo-p-benzamiden durchgeführt. Dies Systeme sind wichtig
als supramolekulare Bausteine mit über die Oligomerlänge anpassbarer
Aggregationsstärke mit stark gerichteten nicht-kovalenten Wechselwirkungen.
(Kooperation SFB Projekt A11) [7, 8].
[1] U. Kolb, T. Gorelik, C. Kübel, M.T. Otten, and D. Hubert, Ultramicroscopy,
107, 507-513 (2007).
[2] MaterialStudio 4.0 and Cerius 2 version 4.2 MS, Accelrys Inc., 9685
Scranton Road, San Diego, CA 92121 - 3752, USA.
[3] U.Kolb and G. Matveeva, Z. Krist., 218, (2003) 259-268.
[4] U.Kolb et al. in: Electron Crystallography, Weirich et al. (eds.),
Kluwer Academic Publishers, Netherlands, NATO ASI Series E: Applied
Sciences. 211, (2005) 421-433 and 411-420.
[5] U. Kolb, K. Büscher, Ch. Helm, A. Lindner, A.F. Thünemann, M. Menzell,
Masayoshi Higuchi and D. G. Kurth, PNAS, 103, 10202-10206 (2006).
[6] G. Goward, D. Sebastiani, I. Schnell, H.W. Spiess, H.-D. Kim, H.
Ishida, J. Am. Chem. Soc., 125 5792 (2006).
[7] H.M. König, R. Abbel, D. Schollmeyer, A.F.M. Kilbinger, Org. Lett.
8, 1819 (2006).
[8] T.W. Schleuss, R. Abbel, M. Groß, D. Schollmeyer, H. Frey, M. Maskos,
R. Berger and A.F.M. Kilbinger, Angew. Chem., 118, 3036, Angew. Chem.
Int. Ed., 45, 2969 (2006).
Projekt 3
Further reading
63) Towards automated diffraction tomography. Part I
- Data Acquisition
U. Kolb, T. Gorelik, C. Kübel, M.T. Otten and D. Hubert, Ultramicroscopy,
107, 507-513 (2007).
DOI 10.1016/j.ultramic.2006.10.007
75) Towards automated diffraction tomography. Part II - cell parameter
determination
U. Kolb, T. Gorelik, M.T. Otten, Ultramicroscopy, 108, 763-772 (2008).
DOI 10.1016/j.ultramic.2007.12.002
89) Automated diffraction tomography combined with electron precession:
a new tool for ab initio nanostructure analysis
U. Kolb, T. Gorelik and E. Mugnaioli, Materials Research Society
Symposia Proceedings 1184 Warrendale PA, USA,GG01-05(2009)
DOI 10.1557/PROC-1184-GG01-05
99°) Structural characterization of organics using manual and automated diffraction tomography
U. Kolb, E. Mugnaioli, T. Gorelik, A. Stewart Polymer Reviews
50 385-409 (2010)
DOI: 10.1080/15583724.2010.494238
111) Complementarities between precession electron and X-ray powder diffraction
U. Kolb and M. Mugnaioli Z. Krist. Proc.
1 1-13 (2010)
DOI: 10.1524/zkpr.2011.0001
115) Automated electron diffraction tomography – a new tool for nano crystal structure analysis
U. Kolb, E. Mugnaioli and T.E. Gorelik Cryst. Res. Technology, Special issue
46 542-554 (2011)
DOI: 10.1002/crat.201100036
122) Ab-initio structure solution of nano-crystalline minerals and synthetic materials by automated electron tomography
E. Mugnaioli, T. Gorelik, A. Stewart and U. Kolb, In Krivovichev S.V.: “Minerals as Advanced Materials II”, Springer, Berlin Heidelberg,
in print .... (2011)
DOI: ...