"Molekulare Phylogenie" - Fernstudium 2011

Praxis

Zeitraum: 14. 3. -18. 3. und 21.3. - 25.3.2011

• Datenbankanlaysen EMBL, GenBank und SwissProt

• BLAST for beginners
• how to access records in NCBI, tutorial

• Script und benötigte Dateien (DNA.seq - Protein.seq - HbA.txt - Aufgabe6.txt)
• 'Wichtiger' Überblick
• Theorie als pdf
• Später verwenden alle bitte HbA.seq
• Sequenzanalyse mittels Chromas lite (freeware)
• Multiple Sequenzvergleiche und Modifikationen mit ClustalX und GeneDoc
• Erstellung von Stammbäumen mit Phylip und Visualisierung mit TreeView

(you can download the zipped program files by clicking on the link above)

Literatur

Inferring Phylogenies, Joseph Felsenstein

Fundamentals of Molecular Evolution, Graur and Li

Bioinformatics, Mount

Seminar